El club deportivo Marathón fue fundado el 25 de noviembre de 1925 en una reunión en la cual estuvieron presentes Eloy Montes, Rubén Cerrato, Carlos Miranda, José Améndola, Abraham Miselem, “Pitoreta” Varela, Alfredo Bueso y Fernando Ferrera, siendo designado el señor Montes como primer presidente.
El nombre del club nació tras que se encargara una pelota de fútbol a la casa Montgomery Ward, con sede en Chicago, Illinois pero el balón enviado resultó ser para la práctica del rugby y era de la marca “Marathon”.
Después de ubicarse en el segundo lugar de los torneos 1966, 1967/68 y 1973, el primer título llegó en 1979 con Ángel Ramón “Mon” Rodríguez como director técnico. Tras alcanzar la final al obtener el liderato de las vueltas regulares, el equipo sampedrano se erigió como monarca al imponerse por idéntica pizarra de 1-0 a la Universidad con tantos de Roberto Bailey en ambos duelos.
El 17 de agosto de 1981, Marathón logró la hazaña de derrotar 1-3 al Cruz Azul en México, erigiéndose como el primer club hondureño en vencer a un equipo azteca en su propio reducto.
En 1985, con la dirección de Gonzalo “Chalito” Zelaya, llegó su segundo título al derrotar 1-0 al Vida en el último juego de la cuadrangular final con un gol de Roy Padilla Bardales.
Luego de nueve años sin conquistas, la escuadra verde se coronó como campeona del Torneo de Copa de 1994 con Hernán García como técnico, ello al derrotar 3-2 al Real Maya.
El 26 de mayo del 2002 logró su tercer título de Liga Nacional al vencer 4-2 a Olimpia en el marcador acumulado de la final cuando era dirigido por José de la Paz Herrera. Un año más tarde, Flavio Ortega lo llevó a superar a Motagua con pizarra global de 4-1 para lograr su cuarto cetro.
En el torneo Apertura 2004 llegó su quinto campeonato con Nicolás Suazo en el banquillo, en esa oportunidad, el representativo del barrio Paz Barahona venció a Olimpia en los dos duelos de la final con marcadores de 3-2 y 1-2.
Los tres últimos campeonatos verdolagas llegaron bajo la conducción de Manuel Keosseian quien llevó al equipo a los títulos de los torneos Apertura de los años 2007, 2008 y 2009 al superar 2-0 a Motagua y 2-1 tanto a Real España como a Olimpia.
A lo largo de sus 91 años de historia, los principales logros de Marathón son los siguientes:
– Campeón de Liga Nacional (1979, 1985, Clausura 2002, Clausura 2003, Apertura 2004, Apertura 2007, Apertura 2008 y Apertura 2009), Campeón de Copa (1994).
– Subcampeón de Liga Nacional (1966, 1967/68, 1973, 1980, 1987, Apertura 2001, Clausura 2004, Clausura 2005, Apertura 2005, Clausura 2007, Clausura 2008, Clausura 2012 y Clausura 2014).
– Acumula 640 triunfos, 579 empates y 508 derrotas, 2194 goles a favor y 1883 en contra tras 1727 partidos.
– Su máximo goleador histórico es Gilberto Leonel Machado con 78 tantos.
– Máximos goleadores: Mauro Caballero (12) (1966/67), Flavio Ortega (18) (1969/70), Allard Plummer (13) /1973), Óscar Rolando Hernández (10) (1976), Leonel Machado (19) (1987), Pompilio Cacho (12) (Clausura 2001) y (10) (Clausura 2003), Enrique Centeno Reneau (8) (Apertura 2001), Emil Martínez (10) (Apertura 2007), Jerry Palacios (13) (Apertura 2009) y Nicolás Cardozo (15) (Apertura 2011).
– Arqueros menos batidos: Erasmo Guerrero (1984), Adelmo Herrera (1986), Dangelo Bautista (1990/91), Pedro Cubillo (1992/93), Juan Pablo Centeno (Apertura 2001), Víctor Coello (Clausura 2003 y Clausura 2004), Shane Orio (Clausura 2011 y Clausura 2012).
– Obtuvo su máximo de victorias al ganar once partidos en los torneos Clausura 2007 y Apertura 2008.
– Impuso su marca de goles al anotar 42 veces en los torneos de 1966 y Clausura 2009.
– Obtuvo su triunfo más amplio en la Liga Nacional al vencer 7-0 al Campamento el 5 de septiembre de 1976 en tanto que en torneos internacionales superó 12-0 al Jong Colombia de Antillas Holandesas el 4 de abril de 1996 en la Recopa de Concacaf.